Publications of Andreas Brune

Nweze, J. E.; Šustr, V.; Brune, A.; Angel, R.: Functional similarity, despite taxonomical divergence in the millipede gut microbiota, points to a common trophic strategy. Microbiome 12, 16 (2024)

Arora, J.; Buček, A.; Hellemans, S.; Beránková, T.; Arias, J. R.; Fisher, B. L.; Clitheroe, C.; Brune, A.; Kinjo, Y.; Šobotník, J. et al.; Bourguignon, T.: Evidence of cospeciation between termites and their gut bacteria on a geological time scale. Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences 290 (2001), 20230619 (2023)

Pavlopoulos, G. A.; Baltoumas, F. A.; Liu, S.; Selvitopi, O.; Camargo, A. P.; Nayfach, S.; Azad, A.; Roux, S.; Call, L.; Ivanova, N. N. et al.; Chen, I. M.; Paez-Espino, D.; Karatzas, E.; Acinas, S. G.; Ahlgren, N.; Attwood, G.; Baldrian, P.; Berry, T.; Bhatnagar, J. M.; Bhaya, D.; Bidle, K. D.; Blanchard, J. L.; Boyd, E. S.; Bowen, J. L.; Bowman, J.; Brawley, S. H.; Brodie, E. L.; Brune, A.; Bryant, D. A.; Buchan, A.; Cadillo-Quiroz, H.; Campbell, B. J.; Cavicchioli, R.; Chuckran, P. F.; Coleman, M.; Crowe, S.; Colman, D. R.; Currie, C. R.; Dangl, J.; Delherbe, N.; Denef, V. J.; Dijkstra, P.; Distel, D. D.; Eloe-Fadrosh, E.; Fisher, K.; Francis, C.; Garoutte, A.; Gaudin, A.; Gerwick, L.; Godoy-Vitorino, F.; Guerra, P.; Guo, J.; Habteselassie, M. Y.; Hallam, S. J.; Hatzenpichler, R.; Hentschel, U.; Hess, M.; Hirsch, A. M.; Hug, L. A.; Hultman, J.; Hunt, D. E.; Huntemann, M.; Inskeep, W. P.; James, T. Y.; Jansson, J.; Johnston, E. R.; Kalyuzhnaya, M.; Kelly, C. N.; Kelly, R. M.; Klassen, J. L.; Nüsslein, K.; Kostka, J. E.; Lindow, S.; Lilleskov, E.; Lynes, M.; Mackelprang, R.; Martin, F. M.; Mason, O. U.; McKay, R. M.; McMahon, K.; Mead, D. A.; Medina, M.; Meredith, L. K.; Mock, T.; Mohn, W. W.; Moran, M. A.; Murray, A.; Neufeld, J. D.; Neumann, R.; Norton, J. M.; Partida-Martinez, L. P.; Pietrasiak, N.; Pelletier, D.; Reddy, T. B. K.; Reese, B. K.; Reichart, N. J.; Reiss, R.; Saito, M. A.; Schachtman, D. P.; Seshadri, R.; Shade, A.; Sherman, D.; Simister, R.; Simon, H.; Stegen, J.; Stepanauskas, R.; Sullivan, M.; Sumner, D. Y.; Teeling, H.; Thamatrakoln, K.; Treseder, K.; Tringe, S.; Vaishampayan, P.; Valentine, D. L.; Waldo, N. B.; Waldrop, M. P.; Walsh, D. A.; Ward, D. M.; Wilkins, M.; Whitman, T.; Woolet, J.; Woyke, T.; Iliopoulos, I.; Konstantinidis, K.; Tiedje, J. M.; Pett-Ridge, J.; Baker, D.; Visel, A.; Ouzounis, C. A.; Ovchinnikov, S.; Buluç, A.; Kyrpides, N. C.; Consortium, N. M. P. F.: Unraveling the functional dark matter through global metagenomics. Nature 622 (7983), pp. 594 - 602 (2023)

Protasov, E.; Nonoh, J. O.; Kästle Silva, J. M.; Mies, U. S.; Herve, V.; Dietrich, C.; Lang, K.; Mikulski, L.; Platt, K.; Poehlein, A. et al.; Köhler-Ramm, T.; Miambi, E.; Boga, H. I.; Feldewert, C.; Ngugi, D. K.; Plarre, R.; Sillam-Dussès, D.; Šobotník, J.; Daniel, R.; Brune, A.: Diversity and taxonomic revision of methanogens and other archaea in the intestinal tract of terrestrial arthropods. Frontiers in Microbiology 14, 1281628 (2023)

Radek, R.; Platt, K.; Oztas, D.; Sobotnik, J.; Sillam-Dusses, D.; Hanus, R.; Brune, A.: New insights into the coevolutionary history of termites and their gut flagellates: Description of Retractinympha glossotermitis gen. nov. sp. nov. (Retractinymphidae fam. nov.). Frontiers in Ecology and Evolution 11, 1111484 (2023)

Treitli, S. C.; Hanousková, P.; Beneš, V.; Brune, A.; Čepička, I.; Hampl, V.: Hydrogenotrophic methanogenesis is the key process in the obligately syntrophic consortium of the anaerobic ameba Pelomyxa schiedti. The ISME Journal 17 (11), pp. 1884 - 1894 (2023)

Song, Y.; Pfeiffer, F.; Radek, R.; Hearne, C.; Hervé, V.; Brune, A.: Comparative analysis of Brucepastera parasyntrophica gen. nov., sp. nov. and Teretinema zuelzerae gen. nov., comb. nov. (Treponemataceae) reveals the importance of interspecies hydrogen transfer in the energy metabolism of spirochetes. Applied and Environmental Microbiology 88 (14), e0050322 (2022)

Brune, A.; Song, Y.; Oren, A.; Paster, B. J.: A new family for 'termite gut treponemes': description of Breznakiellaceae fam. nov., Gracilinema caldarium gen. nov., comb. nov., Leadbettera azotonutricia gen. nov., comb. nov., Helmutkoenigia isoptericolens gen. nov., comb. nov., and Zuelzera stenostrepta gen. nov., comb. nov., and proposal of Rectinemataceae fam. nov. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 72 (5), 005439 (2022)

Arora, J.; Kinjo, Y.; Sobotnik, J.; Bucek, A.; Clitheroe, C.; Stiblik, P.; Roisin, Y.; Zifcakova, L.; Park, Y. C.; Kim, K. Y. et al.; Sillam-Dusses, D.; Herve, V.; Lo, N.; Tokuda, G.; Brune, A.; Bourguignon, T.: The functional evolution of termite gut microbiota. Microbiome 10 (1), 78 (2022)

Loh, H. Q.; Herve, V.; Brune, A.: Metabolic potential for reductive acetogenesis and a novel energy-converting [NiFe] hydrogenase in Bathyarchaeia from termite guts - A genome-centric analysis. Frontiers in Microbiology 11, 635786 (2021)

Strassert, J. F. H.; Wurzbacher, C.; Herve, V.; Antany, T.; Brune, A.; Radek, R.: Long rDNA amplicon sequencing of insect-infecting nephridiophagids reveals their affiliation to the Chytridiomycota and a potential to switch between hosts. Scientific Reports 11 (1), 396 (2021)

Horvathova, T.; Sustr, V.; Chronakova, A.; Semanova, S.; Lang, K.; Dietrich, C.; Hubacek, T.; Ardestani, M. M.; Lara, A. C.; Brune, A. et al.; Simek, M.: Methanogenesis in the digestive tracts of the tropical millipedes Archispirostreptus gigas (Diplopoda, Spirostreptidae) and Epibolus pulchripes (Diplopoda, Pachybolidae). Applied and Environmental Microbiology 87 (15), e00614-21 (2021)

Nayfach, S.; Roux, S.; Seshadri, R.; Udwary, D.; Varghese, N.; Schulz, F.; Wu, D.; Paez-Espino, D.; Chen, I. M.; Huntemann, M. et al.; Palaniappan, K.; Ladau, J.; Mukherjee, S.; Reddy, T. B. K.; Nielsen, T.; Kirton, E.; Faria, J. P.; Edirisinghe, J. N.; Henry, C. S.; Jungbluth, S. P.; Chivian, D.; Dehal, P.; Wood-Charlson, E. M.; Arkin, A. P.; Tringe, S. G.; Visel, A.; Abreu, H.; Acinas, S. G.; Allen, E.; Allen, M. A.; Alteio, L. V.; Andersen, G.; Anesio, A. M.; Attwood, G.; Avila-Magaña, V.; Badis, Y.; Bailey, J.; Baker, B.; Baldrian, P.; Barton, H. A.; Beck, D. A. C.; Becraft, E. D.; Beller, H. R.; Beman, J. M.; Bernier-Latmani, R.; Berry, T. D.; Bertagnolli, A.; Bertilsson, S.; Bhatnagar, J. M.; Bird, J. T.; Blanchard, J. L.; Blumer-Schuette, S. E.; Bohannan, B.; Borton, M. A.; Brady, A.; Brawley, S. H.; Brodie, J.; Brown, S.; Brum, J. R.; Brune, A.; Bryant, D. A.; Buchan, A.; Buckley, D. H.; Buongiorno, J.; Cadillo-Quiroz, H.; Caffrey, S. M.; Campbell, A. N.; Campbell, B.; Carr, S.; Carroll, J. L.; Cary, S. C.; Cates, A. M.; Cattolico, R. A.; Cavicchioli, R.; Chistoserdova, L.; Coleman, M. L.; Constant, P.; Conway, J. M.; Mac Cormack, W. P.; Crowe, S.; Crump, B.; Currie, C.; Daly, R.; DeAngelis, K. M.; Denef, V.; Denman, S. E.; Desta, A.; Dionisi, H.; Dodsworth, J.; Dombrowski, N.; Donohue, T.; Dopson, M.; Driscoll, T.; Dunfield, P.; Dupont, C. L.; Dynarski, K. A.; Edgcomb, V.; Edwards, E. A.; Elshahed, M. S.; Figueroa, I.; Flood, B.; Fortney, N.; Fortunato, C. S.; Francis, C.; Gachon, C. M. M.; Garcia, S. L.; Gazitua, M. C.; Gentry, T.; Gerwick, L.; Gharechahi, J.; Girguis, P.; Gladden, J.; Gradoville, M.; Grasby, S. E.; Gravuer, K.; Grettenberger, C. L.; Gruninger, R. J.; Guo, J.; Habteselassie, M. Y.; Hallam, S. J.; Hatzenpichler, R.; Hausmann, B.; Hazen, T. C.; Hedlund, B.; Henny, C.; Herfort, L.; Hernandez, M.; Hershey, O. S.; Hess, M.; Hollister, E. B.; Hug, L. A.; Hunt, D.; Jansson, J.; Jarett, J.; Kadnikov, V. V.; Kelly, C.; Kelly, R.; Kelly, W.; Kerfeld, C. A.; Kimbrel, J.; Klassen, J. L.; Konstantinidis, K. T.; Lee, L. L.; Li, W. J.; Loder, A. J.; Loy, A.; Lozada, M.; MacGregor, B.; Magnabosco, C.; Maria da Silva, A.; McKay, R. M.; McMahon, K.; McSweeney, C. S.; Medina, M.; Meredith, L.; Mizzi, J.; Mock, T.; Momper, L.; Moran, M. A.; Morgan-Lang, C.; Moser, D.; Muyzer, G.; Myrold, D.; Nash, M.; Nesbø, C. L.; Neumann, A. P.; Neumann, R. B.; Noguera, D.; Northen, T.; Norton, J.; Nowinski, B.; Nüsslein, K.; O’Malley, M. A.; Oliveira, R. S.; Maia de Oliveira, V.; Onstott, T.; Osvatic, J.; Ouyang, Y.; Pachiadaki, M.; Parnell, J.; Partida-Martinez, L. P.; Peay, K. G.; Pelletier, D.; Peng, X.; Pester, M.; Pett-Ridge, J.; Peura, S.; Pjevac, P.; Plominsky, A. M.; Poehlein, A.; Pope, P. B.; Ravin, N.; Redmond, M. C.; Reiss, R.; Rich, V.; Rinke, C.; Rodrigues, J. L. M.; Rodriguez-Reillo, W.; Rossmassler, K.; Sackett, J.; Salekdeh, G. H.; Saleska, S.; Scarborough, M.; Schachtman, D.; Schadt, C. W.; Schrenk, M.; Sczyrba, A.; Sengupta, A.; Setubal, J. C.; Shade, A.; Sharp, C.; Sherman, D. H.; Shubenkova, O. V.; Sierra-Garcia, I. N.; Simister, R.; Simon, H.; Sjöling, S.; Slonczewski, J.; Correa de Souza, R. S.; Spear, J. R.; Stegen, J. C.; Stepanauskas, R.; Stewart, F.; Suen, G.; Sullivan, M.; Sumner, D.; Swan, B. K.; Swingley, W.; Tarn, J.; Taylor, G. T.; Teeling, H.; Tekere, M.; Teske, A.; Thomas, T.; Thrash, C.; Tiedje, J.; Ting, C. S.; Tully, B.; Tyson, G.; Ulloa, O.; Valentine, D. L.; Van Goethem, M. W.; VanderGheynst, J.; Verbeke, T. J.; Vollmers, J.; Vuillemin, A.; Waldo, N. B.; Walsh, D. A.; Weimer, B. C.; Whitman, T.; van der Wielen, P.; Wilkins, M.; Williams, T. J.; Woodcroft, B.; Woolet, J.; Wrighton, K.; Ye, J.; Young, E. B.; Youssef, N. H.; Yu, F. B.; Zemskaya, T. I.; Ziels, R.; Woyke, T.; Mouncey, N. J.; Ivanova, N. N.; Kyrpides, N. C.; Eloe-Fadrosh, E. A.; Consortium, I. M. D.: A genomic catalog of Earth’s microbiomes. Nature Biotechnology 39 (4), pp. 499 - 509 (2021)

Song, Y.; Herve, V.; Radek, R.; Pfeiffer, F.; Zheng, H.; Brune, A.: Characterization and phylogenomic analysis of Breznakiella homolactica gen. nov. sp. nov. indicates that termite gut treponemes evolved from non-acetogenic spirochetes in cockroaches. Environmental Microbiology 23 (8), pp. 4228 - 4245 (2021)

Feldewert, C.; Lang, K.; Brune, A.: The hydrogen threshold of obligately methyl-reducing methanogens. FEMS MICROBIOLOGY LETTERS 367 (17), fnaa137 (2020)

Herve, V.; Liu, P.; Dietrich, C.; Sillarn-Dusses, D.; Stiblik, P.; Sobotnik, J.; Brune, A.: Phylogenomic analysis of 589 metagenome-assembled genomes encompassing all major prokaryotic lineages from the gut of higher termites. PEERJ 8, e8614 (2020)

Michaud, C.; Herve, V.; Dupont, S.; Dubreuil, G.; Bezier, A. M.; Meunier, J.; Brune, A.; Dedeine, F.: Efficient but occasionally imperfect vertical transmission of gut mutualistic protists in a wood-feeding termite. MOLECULAR ECOLOGY 29 (2), pp. 308 - 324 (2020)

Radek, R.; Meuser, K.; Altinay, S.; Lo, N.; Brune, A.: Novel Lineages of Oxymonad Flagellates from the Termite Porotermes adamsoni (Stolotermitidae): the Genera Oxynympha and Termitimonas. PROTIST 170 (6), 125683 (2019)

Lampert, N.; Mikaelyan, A.; Brune, A.: Diet is not the primary driver of bacterial community structure in the gut of litter-feeding cockroaches. BMC MICROBIOLOGY 19 (1), 238 (2019)

Frouz, J.; Lin, Q.; Li, X.; Abakumov, E.; Brune, A.; Sustr, V.: Utilization of Dietary Protein in the Litter-Dwelling Larva of Bibio marci (Diptera: Bibionidae). EURASIAN SOIL SCIENCE 52 (12), pp. 1583 - 1587 (2019)